木村花突然離世，除了予頭指向網友過火的留言和攻擊外，亦有人指摘節目中的剪接手法。有指最近的「摔角服洗衣事件」，木村花因為要價10萬日幣的摔角衣服被另一位成員小林快拿去洗後縮水甩色，因此於節目中責罵男方，這段片段引來了大量的觀眾負評，人氣也大受影響。

有指節目為了刺激收視或製造戲劇化的效果，利用剪接手法刻意去加油加醋，將某些節目成員塑造成得令人討厭，引起網友們的反感，加上節目主持群的言語煽動，令參加節目的素人們成為網友們攻擊的目標。

而日前有媒體爆料，指《雙層公寓》雖然號稱是沒有劇本的實境真人騷，但有離職的員工爆料，指這些素人們在加入節目前，都會被告知要按照「指示」拍攝，而節目單位也有設定好的戀情發展方向和角色設定，如果成員不按照指示拍攝就會被要求重拍，如果聽話鏡頭也會變多。

雖然幾位參加者都出面表示參加而來未曾收到任何的「指示」，但一無阻網友對於節目的熱烈討論和質疑，以下5個曾經被列為節目歷年來的話題情節，未知又是否會有造假成份？

節目的其中一名參賽者松嵜翔平是兼職模特兒和演員，性格不羈的他於節目中自爆會拍攝三級片，更大方將拍攝過程公開，尺度相當大膽，也震憾了不少觀眾。

在《雙層公寓：都會男女》中，只有18歲的高中生永井理子直都在鏡頭前表示自己相當純情，不但未試過與男孩子拍拖或拖手，甚至連著泳衣都會令她害羞流淚，不過卻被室友踢爆她與29歲的寺島速人偷偷接吻，最終永井理子更承認「未曾拍拖」的害羞形象只是演技，實際上她與寺島速人已經會擁抱、接吻甚至過夜！